透過與全日空的聯盟，兩家航空公司提供全年往返新加坡與日本（東京羽田、東京成田、大阪、福岡和名古屋）的聯營航班，以及全日空在日本境內廣泛的航網。
新加坡航空的旅客現在可選擇全日空航網中超過 92 個航點；而全日空旅客也可選擇飛往新加坡航空的120 多個航點。
新加坡航空空中巴士 A380、空中巴士 A350-900、波音 787-10 和波音 777-300ER 客機，以及全日空領先業界的波音 B787-9 客機，均提供一系列頂級機上產品和服務。
[備註：航班及轉機點或目的地可能會有所變更。]
航線
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Tokyo (Haneda) ↔ Akita Tokyo (Haneda) ↔ Hakodate Tokyo (Haneda) ↔ Hiroshima Tokyo (Haneda) ↔ Ishigaki Tokyo (Haneda) ↔ Iwakuni Tokyo (Haneda) ↔ Kagoshima Tokyo (Haneda) ↔ Kochi Tokyo (Haneda) ↔ Komatsu Tokyo (Haneda) ↔ Kumamoto Tokyo (Haneda) ↔ Masuda (Iwami) Tokyo (Haneda) ↔ Matsuyama Tokyo (Haneda) ↔ Miyazaki Tokyo (Haneda) ↔ Odate Noshiro Tokyo (Haneda) ↔ Oita Tokyo (Haneda) ↔ Okayama Tokyo (Haneda) ↔ Okinawa |
Tokyo (Haneda) ↔ Saga Tokyo (Haneda) ↔ Shonai Tokyo (Haneda) ↔ Takamatsu Tokyo (Haneda) ↔ Tokushima Tokyo (Haneda) ↔ Tottori Tokyo (Haneda) ↔ Toyama Tokyo (Haneda) ↔ Yamaguchi-UBE Tokyo (Haneda) ↔ Yonago (Miho) Tokyo (Narita) ↔ Nagoya Tokyo (Narita) ↔ Sapporo Singapore ↔ Tokyo (Haneda) Singapore ↔ Tokyo (Narita) Osaka ↔ Okinawa Osaka ↔ Sapporo Nagoya ↔ Fukuoka |